Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZSCAN20P17040 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZSCAN20P17040 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZSCAN20P17040 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZSCAN20P17040 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZSCAN20P17040 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZSCAN20P17040 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZSCAN20P17040 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ZSCAN20P17040 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZSCAN20P17040 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ZSCAN20P17040 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZSCAN20P17040 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZSCAN20P17040 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZSCAN20P17040 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZSCAN20P17040 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZSCAN20P17040 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZSCAN20P17040 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZSCAN20P17040 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZSCAN20P17040 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZSCAN20P17040 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZSCAN20P17040 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZSCAN20P17040 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZSCAN20P17040 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZSCAN20P17040 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZSCAN20P17040 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ZSCAN20P17040 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZSCAN20P17040 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ZSCAN20P17040 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZSCAN20P17040 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZSCAN20P17040 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZSCAN20P17040 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZSCAN20P17040 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZSCAN20P17040 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZSCAN20P17040 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZSCAN20P17040 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZSCAN20P17040 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms