Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC130P13994 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC130P13994 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC130P13994 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC130P13994 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC130P13994 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC130P13994 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC130P13994 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC130P13994 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC130P13994 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC130P13994 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC130P13994 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC130P13994 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC130P13994 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC130P13994 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC130P13994 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC130P13994 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC130P13994 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC130P13994 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC130P13994 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC130P13994 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC130P13994 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC130P13994 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC130P13994 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC130P13994 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC130P13994 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC130P13994 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC130P13994 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms