Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RALAP11233 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RALAP11233 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RALAP11233 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RALAP11233 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RALAP11233 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RALAP11233 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RALAP11233 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RALAP11233 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RALAP11233 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RALAP11233 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RALAP11233 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RALAP11233 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RALAP11233 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RALAP11233 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RALAP11233 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RALAP11233 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RALAP11233 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RALAP11233 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RALAP11233 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RALAP11233 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RALAP11233 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RALAP11233 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RALAP11233 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RALAP11233 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RALAP11233 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RALAP11233 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RALAP11233 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RALAP11233 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RALAP11233 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RALAP11233 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RALAP11233 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RALAP11233 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RALAP11233 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RALAP11233 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RALAP11233 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RALAP11233 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RALAP11233 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RALAP11233 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RALAP11233 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RALAP11233 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RALAP11233 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RALAP11233 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RALAP11233 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RALAP11233 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RALAP11233 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RALAP11233 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RALAP11233 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RALAP11233 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RALAP11233 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RALAP11233 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RALAP11233 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RALAP11233 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RALAP11233 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RALAP11233 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RALAP11233 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RALAP11233 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RALAP11233 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RALAP11233 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RALAP11233 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RALAP11233 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RALAP11233 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RALAP11233 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RALAP11233 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RALAP11233 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RALAP11233 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RALAP11233 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RALAP11233 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RALAP11233 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RALAP11233 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RALAP11233 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RALAP11233 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RALAP11233 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RALAP11233 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RALAP11233 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RALAP11233 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RALAP11233 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RALAP11233 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RALAP11233 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RALAP11233 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RALAP11233 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RALAP11233 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RALAP11233 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RALAP11233 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RALAP11233 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RALAP11233 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RALAP11233 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RALAP11233 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RALAP11233 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RALAP11233 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RALAP11233 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RALAP11233 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RALAP11233 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RALAP11233 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RALAP11233 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RALAP11233 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RALAP11233 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RALAP11233 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RALAP11233 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RALAP11233 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms