Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD8BP10966 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD8BP10966 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD8BP10966 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD8BP10966 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD8BP10966 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD8BP10966 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD8BP10966 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD8BP10966 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD8BP10966 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD8BP10966 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD8BP10966 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD8BP10966 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD8BP10966 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD8BP10966 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD8BP10966 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD8BP10966 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD8BP10966 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD8BP10966 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD8BP10966 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD8BP10966 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD8BP10966 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD8BP10966 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD8BP10966 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD8BP10966 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD8BP10966 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD8BP10966 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD8BP10966 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD8BP10966 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD8BP10966 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CD8BP10966 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD8BP10966 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD8BP10966 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CD8BP10966 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8BP10966 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8BP10966 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8BP10966 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8BP10966 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD8BP10966 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD8BP10966 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD8BP10966 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD8BP10966 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD8BP10966 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD8BP10966 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD8BP10966 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD8BP10966 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD8BP10966 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD8BP10966 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD8BP10966 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CD8BP10966 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD8BP10966 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD8BP10966 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD8BP10966 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD8BP10966 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD8BP10966 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD8BP10966 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD8BP10966 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CD8BP10966 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD8BP10966 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD8BP10966 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8BP10966 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8BP10966 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8BP10966 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8BP10966 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD8BP10966 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD8BP10966 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD8BP10966 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD8BP10966 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD8BP10966 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8BP10966 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8BP10966 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8BP10966 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD8BP10966 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD8BP10966 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD8BP10966 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD8BP10966 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD8BP10966 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8BP10966 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8BP10966 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8BP10966 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8BP10966 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD8BP10966 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD8BP10966 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD8BP10966 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD8BP10966 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD8BP10966 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD8BP10966 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD8BP10966 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD8BP10966 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8BP10966 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8BP10966 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8BP10966 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8BP10966 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD8BP10966 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8BP10966 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8BP10966 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8BP10966 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD8BP10966 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD8BP10966 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD8BP10966 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms