Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMIGD3P0DMS9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMIGD3P0DMS9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMIGD3P0DMS9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMIGD3P0DMS9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD3P0DMS9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIGD3P0DMS9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD3P0DMS9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms