Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB1P08183 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB1P08183 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB1P08183 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCB1P08183 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB1P08183 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB1P08183 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB1P08183 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB1P08183 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB1P08183 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB1P08183 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB1P08183 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB1P08183 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB1P08183 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB1P08183 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB1P08183 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB1P08183 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB1P08183 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms