Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRYBA1P05813 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRYBA1P05813 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRYBA1P05813 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRYBA1P05813 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRYBA1P05813 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRYBA1P05813 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRYBA1P05813 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRYBA1P05813 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms