Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRYBA1P05813 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRYBA1P05813 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRYBA1P05813 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRYBA1P05813 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRYBA1P05813 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRYBA1P05813 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRYBA1P05813 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRYBA1P05813 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRYBA1P05813 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRYBA1P05813 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRYBA1P05813 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRYBA1P05813 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRYBA1P05813 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRYBA1P05813 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRYBA1P05813 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRYBA1P05813 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRYBA1P05813 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRYBA1P05813 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRYBA1P05813 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRYBA1P05813 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRYBA1P05813 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRYBA1P05813 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRYBA1P05813 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRYBA1P05813 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRYBA1P05813 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRYBA1P05813 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRYBA1P05813 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRYBA1P05813 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRYBA1P05813 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRYBA1P05813 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRYBA1P05813 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRYBA1P05813 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRYBA1P05813 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRYBA1P05813 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRYBA1P05813 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRYBA1P05813 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRYBA1P05813 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRYBA1P05813 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRYBA1P05813 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRYBA1P05813 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRYBA1P05813 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRYBA1P05813 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRYBA1P05813 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRYBA1P05813 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRYBA1P05813 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRYBA1P05813 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRYBA1P05813 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRYBA1P05813 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRYBA1P05813 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRYBA1P05813 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRYBA1P05813 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRYBA1P05813 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRYBA1P05813 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRYBA1P05813 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRYBA1P05813 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRYBA1P05813 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRYBA1P05813 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRYBA1P05813 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRYBA1P05813 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRYBA1P05813 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRYBA1P05813 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRYBA1P05813 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRYBA1P05813 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRYBA1P05813 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRYBA1P05813 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRYBA1P05813 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRYBA1P05813 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRYBA1P05813 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRYBA1P05813 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRYBA1P05813 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRYBA1P05813 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRYBA1P05813 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRYBA1P05813 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRYBA1P05813 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRYBA1P05813 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRYBA1P05813 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRYBA1P05813 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRYBA1P05813 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRYBA1P05813 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRYBA1P05813 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRYBA1P05813 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRYBA1P05813 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRYBA1P05813 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRYBA1P05813 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRYBA1P05813 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRYBA1P05813 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRYBA1P05813 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRYBA1P05813 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRYBA1P05813 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRYBA1P05813 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRYBA1P05813 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRYBA1P05813 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRYBA1P05813 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRYBA1P05813 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRYBA1P05813 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRYBA1P05813 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRYBA1P05813 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CRYBA1P05813 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRYBA1P05813 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms