Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA2P02652 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA2P02652 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA2P02652 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA2P02652 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA2P02652 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA2P02652 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA2P02652 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA2P02652 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA2P02652 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA2P02652 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA2P02652 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA2P02652 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA2P02652 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA2P02652 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA2P02652 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA2P02652 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA2P02652 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA2P02652 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA2P02652 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA2P02652 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA2P02652 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA2P02652 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA2P02652 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA2P02652 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA2P02652 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA2P02652 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA2P02652 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA2P02652 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA2P02652 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA2P02652 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA2P02652 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA2P02652 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA2P02652 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA2P02652 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA2P02652 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA2P02652 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA2P02652 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA2P02652 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA2P02652 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA2P02652 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA2P02652 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA2P02652 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA2P02652 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA2P02652 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA2P02652 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA2P02652 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA2P02652 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA2P02652 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA2P02652 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA2P02652 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOA2P02652 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA2P02652 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA2P02652 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA2P02652 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA2P02652 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA2P02652 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA2P02652 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA2P02652 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA2P02652 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA2P02652 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA2P02652 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA2P02652 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA2P02652 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA2P02652 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA2P02652 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA2P02652 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA2P02652 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA2P02652 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA2P02652 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA2P02652 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA2P02652 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA2P02652 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA2P02652 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA2P02652 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA2P02652 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA2P02652 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA2P02652 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA2P02652 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA2P02652 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA2P02652 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA2P02652 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA2P02652 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA2P02652 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA2P02652 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA2P02652 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA2P02652 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA2P02652 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA2P02652 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA2P02652 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA2P02652 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA2P02652 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA2P02652 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA2P02652 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA2P02652 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA2P02652 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA2P02652 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA2P02652 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA2P02652 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA2P02652 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms