Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOA2P02652 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOA2P02652 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
APOA2P02652 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA2P02652 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA2P02652 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA2P02652 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOA2P02652 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOA2P02652 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA2P02652 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOA2P02652 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOA2P02652 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA2P02652 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA2P02652 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA2P02652 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA2P02652 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA2P02652 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA2P02652 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA2P02652 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA2P02652 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA2P02652 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA2P02652 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA2P02652 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA2P02652 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA2P02652 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA2P02652 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA2P02652 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA2P02652 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA2P02652 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA2P02652 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA2P02652 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOA2P02652 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOA2P02652 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA2P02652 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA2P02652 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA2P02652 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA2P02652 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA2P02652 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA2P02652 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA2P02652 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA2P02652 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA2P02652 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA2P02652 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOA2P02652 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA2P02652 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA2P02652 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA2P02652 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA2P02652 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA2P02652 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA2P02652 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOA2P02652 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA2P02652 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOA2P02652 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA2P02652 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA2P02652 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA2P02652 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA2P02652 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA2P02652 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA2P02652 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA2P02652 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA2P02652 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA2P02652 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA2P02652 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA2P02652 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA2P02652 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA2P02652 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA2P02652 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA2P02652 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA2P02652 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA2P02652 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA2P02652 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA2P02652 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA2P02652 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA2P02652 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA2P02652 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA2P02652 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA2P02652 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOA2P02652 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA2P02652 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA2P02652 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA2P02652 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA2P02652 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA2P02652 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA2P02652 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA2P02652 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA2P02652 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA2P02652 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA2P02652 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA2P02652 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA2P02652 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA2P02652 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA2P02652 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA2P02652 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA2P02652 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA2P02652 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA2P02652 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA2P02652 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOA2P02652 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA2P02652 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA2P02652 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms