Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV1-17P01599 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV1-17P01599 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV1-17P01599 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV1-17P01599 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV1-17P01599 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV1-17P01599 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV1-17P01599 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV1-17P01599 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV1-17P01599 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV1-17P01599 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IGKV1-17P01599 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IGKV1-17P01599 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGKV1-17P01599 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGKV1-17P01599 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms