Protein–RNA interactions for Protein: P01584

IL1B, Interleukin-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1BP01584 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IL1BP01584 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IL1BP01584 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IL1BP01584 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IL1BP01584 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IL1BP01584 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IL1BP01584 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IL1BP01584 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IL1BP01584 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IL1BP01584 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IL1BP01584 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IL1BP01584 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IL1BP01584 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IL1BP01584 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IL1BP01584 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IL1BP01584 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IL1BP01584 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IL1BP01584 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IL1BP01584 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IL1BP01584 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IL1BP01584 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IL1BP01584 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IL1BP01584 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IL1BP01584 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IL1BP01584 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IL1BP01584 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IL1BP01584 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IL1BP01584 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IL1BP01584 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IL1BP01584 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IL1BP01584 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IL1BP01584 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IL1BP01584 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IL1BP01584 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IL1BP01584 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IL1BP01584 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IL1BP01584 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IL1BP01584 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IL1BP01584 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IL1BP01584 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IL1BP01584 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IL1BP01584 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IL1BP01584 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IL1BP01584 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IL1BP01584 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IL1BP01584 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IL1BP01584 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IL1BP01584 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IL1BP01584 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IL1BP01584 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IL1BP01584 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IL1BP01584 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IL1BP01584 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IL1BP01584 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IL1BP01584 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IL1BP01584 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IL1BP01584 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IL1BP01584 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
IL1BP01584 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IL1BP01584 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IL1BP01584 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IL1BP01584 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IL1BP01584 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IL1BP01584 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IL1BP01584 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IL1BP01584 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IL1BP01584 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IL1BP01584 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IL1BP01584 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IL1BP01584 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IL1BP01584 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IL1BP01584 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IL1BP01584 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IL1BP01584 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IL1BP01584 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IL1BP01584 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
IL1BP01584 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IL1BP01584 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IL1BP01584 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IL1BP01584 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IL1BP01584 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IL1BP01584 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IL1BP01584 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IL1BP01584 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IL1BP01584 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IL1BP01584 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IL1BP01584 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IL1BP01584 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IL1BP01584 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IL1BP01584 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IL1BP01584 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IL1BP01584 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IL1BP01584 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IL1BP01584 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IL1BP01584 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IL1BP01584 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IL1BP01584 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IL1BP01584 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IL1BP01584 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IL1BP01584 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms