Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAPBO95292 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAPBO95292 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAPBO95292 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAPBO95292 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAPBO95292 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAPBO95292 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAPBO95292 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAPBO95292 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAPBO95292 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAPBO95292 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAPBO95292 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VAPBO95292 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAPBO95292 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAPBO95292 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAPBO95292 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAPBO95292 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAPBO95292 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAPBO95292 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAPBO95292 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAPBO95292 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAPBO95292 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAPBO95292 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAPBO95292 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAPBO95292 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAPBO95292 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAPBO95292 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAPBO95292 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAPBO95292 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
VAPBO95292 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAPBO95292 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAPBO95292 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAPBO95292 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAPBO95292 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAPBO95292 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAPBO95292 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAPBO95292 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VAPBO95292 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAPBO95292 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VAPBO95292 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAPBO95292 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAPBO95292 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAPBO95292 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VAPBO95292 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAPBO95292 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VAPBO95292 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAPBO95292 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAPBO95292 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VAPBO95292 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAPBO95292 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAPBO95292 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAPBO95292 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAPBO95292 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAPBO95292 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAPBO95292 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAPBO95292 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAPBO95292 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAPBO95292 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAPBO95292 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAPBO95292 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VAPBO95292 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAPBO95292 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAPBO95292 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VAPBO95292 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAPBO95292 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAPBO95292 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAPBO95292 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAPBO95292 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAPBO95292 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAPBO95292 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAPBO95292 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAPBO95292 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAPBO95292 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAPBO95292 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAPBO95292 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAPBO95292 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VAPBO95292 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAPBO95292 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VAPBO95292 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAPBO95292 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAPBO95292 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAPBO95292 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAPBO95292 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAPBO95292 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAPBO95292 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAPBO95292 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAPBO95292 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAPBO95292 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAPBO95292 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAPBO95292 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAPBO95292 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAPBO95292 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAPBO95292 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAPBO95292 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAPBO95292 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VAPBO95292 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAPBO95292 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAPBO95292 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAPBO95292 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAPBO95292 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms