Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALMO75781 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALMO75781 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PALMO75781 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PALMO75781 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PALMO75781 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PALMO75781 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PALMO75781 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PALMO75781 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALMO75781 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALMO75781 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALMO75781 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALMO75781 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PALMO75781 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALMO75781 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALMO75781 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PALMO75781 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALMO75781 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALMO75781 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALMO75781 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALMO75781 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALMO75781 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALMO75781 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALMO75781 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALMO75781 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PALMO75781 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PALMO75781 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALMO75781 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALMO75781 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PALMO75781 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PALMO75781 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALMO75781 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALMO75781 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PALMO75781 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PALMO75781 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PALMO75781 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PALMO75781 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PALMO75781 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PALMO75781 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PALMO75781 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PALMO75781 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PALMO75781 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PALMO75781 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PALMO75781 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PALMO75781 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PALMO75781 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PALMO75781 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PALMO75781 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PALMO75781 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PALMO75781 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PALMO75781 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALMO75781 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALMO75781 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALMO75781 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PALMO75781 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PALMO75781 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PALMO75781 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALMO75781 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALMO75781 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PALMO75781 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PALMO75781 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALMO75781 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALMO75781 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALMO75781 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PALMO75781 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALMO75781 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALMO75781 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALMO75781 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALMO75781 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALMO75781 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALMO75781 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALMO75781 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALMO75781 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALMO75781 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PALMO75781 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALMO75781 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PALMO75781 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PALMO75781 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALMO75781 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALMO75781 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PALMO75781 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PALMO75781 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALMO75781 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALMO75781 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALMO75781 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALMO75781 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALMO75781 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALMO75781 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALMO75781 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALMO75781 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PALMO75781 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PALMO75781 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PALMO75781 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALMO75781 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALMO75781 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALMO75781 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALMO75781 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALMO75781 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALMO75781 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALMO75781 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms