Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PALMO75781 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PALMO75781 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PALMO75781 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PALMO75781 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PALMO75781 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PALMO75781 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PALMO75781 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PALMO75781 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PALMO75781 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PALMO75781 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PALMO75781 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PALMO75781 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PALMO75781 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PALMO75781 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PALMO75781 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PALMO75781 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PALMO75781 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PALMO75781 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PALMO75781 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PALMO75781 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PALMO75781 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PALMO75781 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PALMO75781 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PALMO75781 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PALMO75781 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PALMO75781 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PALMO75781 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PALMO75781 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PALMO75781 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PALMO75781 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PALMO75781 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PALMO75781 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PALMO75781 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PALMO75781 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PALMO75781 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PALMO75781 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PALMO75781 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PALMO75781 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PALMO75781 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PALMO75781 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PALMO75781 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PALMO75781 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PALMO75781 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PALMO75781 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PALMO75781 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PALMO75781 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PALMO75781 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PALMO75781 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PALMO75781 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PALMO75781 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PALMO75781 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PALMO75781 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PALMO75781 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PALMO75781 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PALMO75781 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PALMO75781 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PALMO75781 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PALMO75781 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PALMO75781 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PALMO75781 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PALMO75781 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PALMO75781 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PALMO75781 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PALMO75781 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PALMO75781 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PALMO75781 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PALMO75781 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PALMO75781 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PALMO75781 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PALMO75781 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PALMO75781 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PALMO75781 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PALMO75781 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PALMO75781 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PALMO75781 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PALMO75781 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PALMO75781 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PALMO75781 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PALMO75781 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PALMO75781 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PALMO75781 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PALMO75781 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PALMO75781 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PALMO75781 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PALMO75781 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PALMO75781 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PALMO75781 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PALMO75781 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PALMO75781 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PALMO75781 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PALMO75781 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PALMO75781 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PALMO75781 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PALMO75781 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PALMO75781 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PALMO75781 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PALMO75781 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PALMO75781 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PALMO75781 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms