Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PPFIA4O75335 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PPFIA4O75335 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PPFIA4O75335 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PPFIA4O75335 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PPFIA4O75335 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIA4O75335 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PPFIA4O75335 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PPFIA4O75335 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PPFIA4O75335 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPFIA4O75335 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPFIA4O75335 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPFIA4O75335 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPFIA4O75335 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPFIA4O75335 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PPFIA4O75335 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PPFIA4O75335 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPFIA4O75335 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PPFIA4O75335 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA4O75335 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms