Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PPFIA4O75335 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPFIA4O75335 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PPFIA4O75335 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PPFIA4O75335 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PPFIA4O75335 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PPFIA4O75335 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPFIA4O75335 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
PPFIA4O75335 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PPFIA4O75335 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPFIA4O75335 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPFIA4O75335 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PPFIA4O75335 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPFIA4O75335 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPFIA4O75335 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPFIA4O75335 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PPFIA4O75335 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPFIA4O75335 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PPFIA4O75335 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PPFIA4O75335 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PPFIA4O75335 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PPFIA4O75335 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PPFIA4O75335 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPFIA4O75335 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPFIA4O75335 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPFIA4O75335 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPFIA4O75335 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPFIA4O75335 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPFIA4O75335 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPFIA4O75335 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PPFIA4O75335 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PPFIA4O75335 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PPFIA4O75335 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PPFIA4O75335 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PPFIA4O75335 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPFIA4O75335 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PPFIA4O75335 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PPFIA4O75335 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PPFIA4O75335 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
PPFIA4O75335 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPFIA4O75335 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPFIA4O75335 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPFIA4O75335 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPFIA4O75335 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PPFIA4O75335 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPFIA4O75335 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PPFIA4O75335 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPFIA4O75335 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPFIA4O75335 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPFIA4O75335 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPFIA4O75335 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPFIA4O75335 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPFIA4O75335 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPFIA4O75335 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PPFIA4O75335 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPFIA4O75335 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPFIA4O75335 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPFIA4O75335 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPFIA4O75335 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPFIA4O75335 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPFIA4O75335 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPFIA4O75335 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPFIA4O75335 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPFIA4O75335 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPFIA4O75335 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PPFIA4O75335 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPFIA4O75335 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPFIA4O75335 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPFIA4O75335 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPFIA4O75335 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPFIA4O75335 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPFIA4O75335 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPFIA4O75335 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPFIA4O75335 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPFIA4O75335 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPFIA4O75335 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPFIA4O75335 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPFIA4O75335 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PPFIA4O75335 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPFIA4O75335 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PPFIA4O75335 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPFIA4O75335 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPFIA4O75335 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPFIA4O75335 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PPFIA4O75335 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPFIA4O75335 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPFIA4O75335 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PPFIA4O75335 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PPFIA4O75335 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPFIA4O75335 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPFIA4O75335 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPFIA4O75335 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PPFIA4O75335 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPFIA4O75335 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPFIA4O75335 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PPFIA4O75335 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPFIA4O75335 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PPFIA4O75335 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PPFIA4O75335 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPFIA4O75335 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms