Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOBOXO60393 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOBOXO60393 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOBOXO60393 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOBOXO60393 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOBOXO60393 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOBOXO60393 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOBOXO60393 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOBOXO60393 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOBOXO60393 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOBOXO60393 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NOBOXO60393 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOBOXO60393 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOBOXO60393 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOBOXO60393 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOBOXO60393 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOBOXO60393 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOBOXO60393 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOBOXO60393 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOBOXO60393 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOBOXO60393 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOBOXO60393 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms