Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM1AO60341 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM1AO60341 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM1AO60341 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM1AO60341 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM1AO60341 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM1AO60341 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM1AO60341 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM1AO60341 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM1AO60341 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM1AO60341 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM1AO60341 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM1AO60341 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM1AO60341 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM1AO60341 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1AO60341 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1AO60341 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM1AO60341 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM1AO60341 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM1AO60341 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1AO60341 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM1AO60341 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms