Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKNO60260 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKNO60260 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKNO60260 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKNO60260 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKNO60260 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKNO60260 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKNO60260 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKNO60260 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKNO60260 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKNO60260 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKNO60260 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKNO60260 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKNO60260 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKNO60260 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKNO60260 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKNO60260 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKNO60260 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKNO60260 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKNO60260 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKNO60260 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKNO60260 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKNO60260 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKNO60260 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKNO60260 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKNO60260 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKNO60260 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKNO60260 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKNO60260 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKNO60260 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKNO60260 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKNO60260 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKNO60260 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKNO60260 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKNO60260 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKNO60260 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKNO60260 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKNO60260 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKNO60260 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKNO60260 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKNO60260 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKNO60260 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKNO60260 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKNO60260 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKNO60260 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKNO60260 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKNO60260 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKNO60260 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKNO60260 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKNO60260 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKNO60260 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKNO60260 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKNO60260 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKNO60260 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKNO60260 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKNO60260 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKNO60260 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKNO60260 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKNO60260 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKNO60260 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKNO60260 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKNO60260 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKNO60260 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKNO60260 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRKNO60260 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKNO60260 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKNO60260 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKNO60260 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKNO60260 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKNO60260 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKNO60260 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKNO60260 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKNO60260 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKNO60260 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKNO60260 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKNO60260 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKNO60260 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKNO60260 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKNO60260 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKNO60260 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKNO60260 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKNO60260 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKNO60260 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKNO60260 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKNO60260 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKNO60260 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKNO60260 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKNO60260 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKNO60260 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKNO60260 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKNO60260 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKNO60260 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKNO60260 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKNO60260 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKNO60260 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKNO60260 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKNO60260 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKNO60260 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKNO60260 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKNO60260 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms