Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIMM44O43615 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TIMM44O43615 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIMM44O43615 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIMM44O43615 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TIMM44O43615 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TIMM44O43615 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIMM44O43615 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMM44O43615 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms