Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRY3O43610 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRY3O43610 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRY3O43610 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRY3O43610 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRY3O43610 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRY3O43610 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRY3O43610 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRY3O43610 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRY3O43610 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRY3O43610 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRY3O43610 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRY3O43610 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRY3O43610 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRY3O43610 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRY3O43610 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRY3O43610 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRY3O43610 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRY3O43610 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY3O43610 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRY3O43610 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRY3O43610 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRY3O43610 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRY3O43610 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY3O43610 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY3O43610 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms