Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSTPIP1O43586 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSTPIP1O43586 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSTPIP1O43586 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSTPIP1O43586 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSTPIP1O43586 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSTPIP1O43586 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSTPIP1O43586 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSTPIP1O43586 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSTPIP1O43586 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSTPIP1O43586 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSTPIP1O43586 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSTPIP1O43586 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSTPIP1O43586 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSTPIP1O43586 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PSTPIP1O43586 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSTPIP1O43586 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSTPIP1O43586 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSTPIP1O43586 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSTPIP1O43586 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSTPIP1O43586 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSTPIP1O43586 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSTPIP1O43586 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PSTPIP1O43586 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSTPIP1O43586 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSTPIP1O43586 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PSTPIP1O43586 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PSTPIP1O43586 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSTPIP1O43586 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSTPIP1O43586 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSTPIP1O43586 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSTPIP1O43586 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSTPIP1O43586 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms