Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF1O43189 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF1O43189 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF1O43189 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF1O43189 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF1O43189 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF1O43189 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF1O43189 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF1O43189 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF1O43189 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF1O43189 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF1O43189 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF1O43189 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF1O43189 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF1O43189 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF1O43189 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF1O43189 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF1O43189 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF1O43189 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF1O43189 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF1O43189 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF1O43189 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF1O43189 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF1O43189 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF1O43189 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF1O43189 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF1O43189 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF1O43189 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF1O43189 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF1O43189 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF1O43189 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF1O43189 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF1O43189 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF1O43189 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF1O43189 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF1O43189 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF1O43189 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF1O43189 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF1O43189 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF1O43189 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF1O43189 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF1O43189 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF1O43189 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF1O43189 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF1O43189 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF1O43189 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF1O43189 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF1O43189 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF1O43189 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHF1O43189 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF1O43189 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF1O43189 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF1O43189 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF1O43189 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF1O43189 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF1O43189 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF1O43189 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF1O43189 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF1O43189 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF1O43189 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF1O43189 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF1O43189 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF1O43189 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF1O43189 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF1O43189 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF1O43189 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF1O43189 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF1O43189 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF1O43189 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF1O43189 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF1O43189 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF1O43189 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF1O43189 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF1O43189 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF1O43189 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF1O43189 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF1O43189 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF1O43189 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF1O43189 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF1O43189 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF1O43189 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF1O43189 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF1O43189 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF1O43189 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF1O43189 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF1O43189 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF1O43189 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF1O43189 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF1O43189 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF1O43189 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF1O43189 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF1O43189 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF1O43189 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF1O43189 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF1O43189 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF1O43189 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF1O43189 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF1O43189 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF1O43189 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF1O43189 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms