Protein–RNA interactions for Protein: O15432

SLC31A2, Probable low affinity copper uptake protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC31A2O15432 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC31A2O15432 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC31A2O15432 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC31A2O15432 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC31A2O15432 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC31A2O15432 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC31A2O15432 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC31A2O15432 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC31A2O15432 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC31A2O15432 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC31A2O15432 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC31A2O15432 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC31A2O15432 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC31A2O15432 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC31A2O15432 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC31A2O15432 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC31A2O15432 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC31A2O15432 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC31A2O15432 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC31A2O15432 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC31A2O15432 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC31A2O15432 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC31A2O15432 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms