Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLGNO14967 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLGNO14967 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLGNO14967 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLGNO14967 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLGNO14967 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLGNO14967 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLGNO14967 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLGNO14967 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLGNO14967 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLGNO14967 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLGNO14967 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLGNO14967 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLGNO14967 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLGNO14967 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLGNO14967 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLGNO14967 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLGNO14967 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLGNO14967 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLGNO14967 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLGNO14967 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLGNO14967 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLGNO14967 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLGNO14967 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLGNO14967 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLGNO14967 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLGNO14967 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLGNO14967 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLGNO14967 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLGNO14967 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLGNO14967 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLGNO14967 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLGNO14967 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLGNO14967 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLGNO14967 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLGNO14967 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLGNO14967 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLGNO14967 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLGNO14967 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLGNO14967 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLGNO14967 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLGNO14967 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLGNO14967 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLGNO14967 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLGNO14967 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLGNO14967 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLGNO14967 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLGNO14967 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLGNO14967 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLGNO14967 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLGNO14967 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLGNO14967 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLGNO14967 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLGNO14967 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLGNO14967 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLGNO14967 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLGNO14967 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLGNO14967 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLGNO14967 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLGNO14967 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLGNO14967 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLGNO14967 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLGNO14967 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLGNO14967 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLGNO14967 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLGNO14967 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLGNO14967 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLGNO14967 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLGNO14967 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLGNO14967 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLGNO14967 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLGNO14967 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLGNO14967 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLGNO14967 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLGNO14967 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLGNO14967 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLGNO14967 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLGNO14967 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLGNO14967 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLGNO14967 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLGNO14967 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLGNO14967 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLGNO14967 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLGNO14967 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLGNO14967 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLGNO14967 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLGNO14967 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLGNO14967 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLGNO14967 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLGNO14967 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLGNO14967 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLGNO14967 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLGNO14967 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLGNO14967 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLGNO14967 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLGNO14967 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLGNO14967 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLGNO14967 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLGNO14967 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLGNO14967 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms