Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRDMT1O14717 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRDMT1O14717 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRDMT1O14717 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRDMT1O14717 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRDMT1O14717 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRDMT1O14717 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRDMT1O14717 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRDMT1O14717 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRDMT1O14717 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRDMT1O14717 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRDMT1O14717 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRDMT1O14717 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRDMT1O14717 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRDMT1O14717 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
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