Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOCS6O14544 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOCS6O14544 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS6O14544 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS6O14544 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOCS6O14544 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOCS6O14544 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms