Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEN1O00255 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEN1O00255 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEN1O00255 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEN1O00255 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEN1O00255 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MEN1O00255 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEN1O00255 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEN1O00255 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEN1O00255 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MEN1O00255 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEN1O00255 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MEN1O00255 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEN1O00255 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEN1O00255 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEN1O00255 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEN1O00255 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEN1O00255 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEN1O00255 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MEN1O00255 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEN1O00255 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEN1O00255 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEN1O00255 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEN1O00255 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEN1O00255 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEN1O00255 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEN1O00255 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEN1O00255 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEN1O00255 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEN1O00255 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEN1O00255 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEN1O00255 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEN1O00255 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEN1O00255 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEN1O00255 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEN1O00255 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEN1O00255 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEN1O00255 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEN1O00255 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEN1O00255 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEN1O00255 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEN1O00255 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEN1O00255 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEN1O00255 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEN1O00255 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MEN1O00255 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEN1O00255 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEN1O00255 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEN1O00255 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEN1O00255 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEN1O00255 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEN1O00255 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEN1O00255 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEN1O00255 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEN1O00255 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEN1O00255 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEN1O00255 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEN1O00255 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEN1O00255 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEN1O00255 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEN1O00255 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEN1O00255 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEN1O00255 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEN1O00255 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEN1O00255 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEN1O00255 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEN1O00255 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEN1O00255 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEN1O00255 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEN1O00255 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEN1O00255 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MEN1O00255 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEN1O00255 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEN1O00255 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEN1O00255 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEN1O00255 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEN1O00255 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEN1O00255 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEN1O00255 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEN1O00255 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEN1O00255 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEN1O00255 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEN1O00255 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEN1O00255 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEN1O00255 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEN1O00255 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEN1O00255 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEN1O00255 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEN1O00255 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEN1O00255 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEN1O00255 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MEN1O00255 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEN1O00255 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MEN1O00255 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEN1O00255 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEN1O00255 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEN1O00255 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MEN1O00255 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEN1O00255 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MEN1O00255 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240 ms