Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
I3L4J1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
I3L4J1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
I3L4J1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
I3L4J1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
I3L4J1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
I3L4J1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
I3L4J1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
I3L4J1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
I3L4J1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
I3L4J1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
I3L4J1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
I3L4J1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
I3L4J1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
I3L4J1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
I3L4J1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
I3L4J1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
I3L4J1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
I3L4J1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
I3L4J1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
I3L4J1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
I3L4J1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
I3L4J1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
I3L4J1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
I3L4J1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
I3L4J1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
I3L4J1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
I3L4J1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
I3L4J1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
I3L4J1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
I3L4J1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
I3L4J1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
I3L4J1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
I3L4J1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
I3L4J1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
I3L4J1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
I3L4J1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
I3L4J1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
I3L4J1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
I3L4J1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
I3L4J1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
I3L4J1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
I3L4J1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
I3L4J1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
I3L4J1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
I3L4J1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
I3L4J1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
I3L4J1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
I3L4J1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
I3L4J1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
I3L4J1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
I3L4J1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
I3L4J1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
I3L4J1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
I3L4J1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
I3L4J1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
I3L4J1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
I3L4J1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
I3L4J1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
I3L4J1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
I3L4J1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
I3L4J1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
I3L4J1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
I3L4J1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
I3L4J1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
I3L4J1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
I3L4J1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
I3L4J1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
I3L4J1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
I3L4J1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
I3L4J1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
I3L4J1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
I3L4J1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
I3L4J1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
I3L4J1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
I3L4J1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
I3L4J1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
I3L4J1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
I3L4J1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
I3L4J1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
I3L4J1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
I3L4J1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
I3L4J1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
I3L4J1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
I3L4J1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
I3L4J1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
I3L4J1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
I3L4J1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
I3L4J1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
I3L4J1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
I3L4J1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms