Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4DXG7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4DXG7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4DXG7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4DXG7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
B4DXG7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4DXG7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4DXG7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4DXG7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4DXG7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4DXG7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4DXG7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4DXG7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4DXG7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4DXG7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4DXG7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4DXG7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
B4DXG7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
B4DXG7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4DXG7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
B4DXG7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4DXG7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4DXG7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4DXG7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4DXG7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4DXG7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4DXG7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4DXG7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4DXG7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4DXG7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4DXG7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4DXG7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4DXG7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4DXG7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
B4DXG7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4DXG7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4DXG7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4DXG7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4DXG7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
B4DXG7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4DXG7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4DXG7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4DXG7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4DXG7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4DXG7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4DXG7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4DXG7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4DXG7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4DXG7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
B4DXG7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4DXG7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4DXG7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4DXG7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4DXG7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4DXG7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4DXG7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DXG7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DXG7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DXG7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DXG7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DXG7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DXG7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DXG7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4DXG7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4DXG7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4DXG7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4DXG7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4DXG7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4DXG7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4DXG7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4DXG7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4DXG7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4DXG7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4DXG7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4DXG7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4DXG7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4DXG7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DXG7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DXG7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DXG7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4DXG7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4DXG7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4DXG7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4DXG7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4DXG7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DXG7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DXG7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DXG7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DXG7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4DXG7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DXG7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4DXG7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4DXG7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DXG7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4DXG7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4DXG7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4DXG7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4DXG7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4DXG7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4DXG7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms