Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IDSB3KWA1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IDSB3KWA1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IDSB3KWA1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IDSB3KWA1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IDSB3KWA1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IDSB3KWA1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IDSB3KWA1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IDSB3KWA1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IDSB3KWA1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IDSB3KWA1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IDSB3KWA1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms