Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
IDSB3KWA1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
IDSB3KWA1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
IDSB3KWA1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
IDSB3KWA1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IDSB3KWA1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IDSB3KWA1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
IDSB3KWA1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IDSB3KWA1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
IDSB3KWA1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IDSB3KWA1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IDSB3KWA1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IDSB3KWA1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IDSB3KWA1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IDSB3KWA1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IDSB3KWA1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IDSB3KWA1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IDSB3KWA1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IDSB3KWA1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IDSB3KWA1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IDSB3KWA1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IDSB3KWA1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IDSB3KWA1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IDSB3KWA1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IDSB3KWA1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IDSB3KWA1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IDSB3KWA1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IDSB3KWA1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IDSB3KWA1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IDSB3KWA1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IDSB3KWA1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IDSB3KWA1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IDSB3KWA1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IDSB3KWA1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IDSB3KWA1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IDSB3KWA1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IDSB3KWA1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IDSB3KWA1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IDSB3KWA1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IDSB3KWA1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IDSB3KWA1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IDSB3KWA1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IDSB3KWA1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IDSB3KWA1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IDSB3KWA1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IDSB3KWA1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IDSB3KWA1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IDSB3KWA1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IDSB3KWA1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IDSB3KWA1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IDSB3KWA1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IDSB3KWA1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IDSB3KWA1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IDSB3KWA1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IDSB3KWA1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IDSB3KWA1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IDSB3KWA1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IDSB3KWA1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IDSB3KWA1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IDSB3KWA1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IDSB3KWA1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IDSB3KWA1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IDSB3KWA1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IDSB3KWA1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IDSB3KWA1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IDSB3KWA1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IDSB3KWA1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IDSB3KWA1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IDSB3KWA1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IDSB3KWA1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IDSB3KWA1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IDSB3KWA1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IDSB3KWA1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IDSB3KWA1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IDSB3KWA1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IDSB3KWA1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IDSB3KWA1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IDSB3KWA1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IDSB3KWA1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IDSB3KWA1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IDSB3KWA1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDSB3KWA1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IDSB3KWA1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IDSB3KWA1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IDSB3KWA1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IDSB3KWA1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IDSB3KWA1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IDSB3KWA1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IDSB3KWA1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IDSB3KWA1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IDSB3KWA1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IDSB3KWA1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IDSB3KWA1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IDSB3KWA1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IDSB3KWA1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IDSB3KWA1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IDSB3KWA1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IDSB3KWA1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IDSB3KWA1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IDSB3KWA1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms