Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YJEFN3A6XGL0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YJEFN3A6XGL0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YJEFN3A6XGL0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YJEFN3A6XGL0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YJEFN3A6XGL0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YJEFN3A6XGL0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YJEFN3A6XGL0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
YJEFN3A6XGL0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
YJEFN3A6XGL0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YJEFN3A6XGL0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YJEFN3A6XGL0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YJEFN3A6XGL0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YJEFN3A6XGL0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YJEFN3A6XGL0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YJEFN3A6XGL0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
YJEFN3A6XGL0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YJEFN3A6XGL0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
YJEFN3A6XGL0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
YJEFN3A6XGL0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YJEFN3A6XGL0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YJEFN3A6XGL0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
YJEFN3A6XGL0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
YJEFN3A6XGL0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YJEFN3A6XGL0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
YJEFN3A6XGL0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms