Protein–RNA interactions for Protein: A6NK97

SLC22A20, Solute carrier family 22 member 20, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A20A6NK97 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A20A6NK97 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A20A6NK97 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A20A6NK97 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC22A20A6NK97 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC22A20A6NK97 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC22A20A6NK97 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A20A6NK97 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A20A6NK97 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC22A20A6NK97 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A20A6NK97 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A20A6NK97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A20A6NK97 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A20A6NK97 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC22A20A6NK97 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms