Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN8A6NHC0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN8A6NHC0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN8A6NHC0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN8A6NHC0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN8A6NHC0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN8A6NHC0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN8A6NHC0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN8A6NHC0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN8A6NHC0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN8A6NHC0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN8A6NHC0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN8A6NHC0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN8A6NHC0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPN8A6NHC0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN8A6NHC0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPN8A6NHC0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN8A6NHC0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN8A6NHC0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN8A6NHC0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN8A6NHC0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN8A6NHC0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN8A6NHC0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN8A6NHC0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN8A6NHC0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN8A6NHC0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN8A6NHC0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN8A6NHC0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN8A6NHC0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN8A6NHC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN8A6NHC0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN8A6NHC0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN8A6NHC0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPN8A6NHC0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.5 ms