Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0J9YYE9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0J9YYE9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0J9YYE9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0J9YYE9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0J9YYE9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0J9YYE9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0J9YYE9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0J9YYE9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0J9YYE9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0J9YYE9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0J9YYE9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0J9YYE9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0J9YYE9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0J9YYE9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0J9YYE9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0J9YYE9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0J9YYE9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0J9YYE9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0J9YYE9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0J9YYE9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0J9YYE9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0J9YYE9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0J9YYE9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0J9YYE9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0J9YYE9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0J9YYE9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0J9YYE9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0J9YYE9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0J9YYE9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0J9YYE9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0J9YYE9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0J9YYE9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A0J9YYE9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0J9YYE9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms