Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J269

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J269 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
A0A0B4J269 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
A0A0B4J269 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
A0A0B4J269 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A0B4J269 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
A0A0B4J269 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
A0A0B4J269 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
A0A0B4J269 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
A0A0B4J269 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
A0A0B4J269 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A0B4J269 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A0A0B4J269 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A0A0B4J269 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A0B4J269 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A0B4J269 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A0B4J269 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A0B4J269 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
A0A0B4J269 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
A0A0B4J269 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A0B4J269 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A0B4J269 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
A0A0B4J269 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A0B4J269 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A0B4J269 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A0B4J269 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
A0A0B4J269 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
A0A0B4J269 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
A0A0B4J269 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
A0A0B4J269 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
A0A0B4J269 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
A0A0B4J269 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
A0A0B4J269 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
A0A0B4J269 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A0B4J269 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
A0A0B4J269 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
A0A0B4J269 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
A0A0B4J269 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A0B4J269 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A0B4J269 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A0B4J269 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A0B4J269 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
A0A0B4J269 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
A0A0B4J269 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
A0A0B4J269 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0B4J269 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0B4J269 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms