Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS06

TRBV23-1, T-cell receptor beta variable 23-1 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV23-1A0A0A0MS06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV23-1A0A0A0MS06 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV23-1A0A0A0MS06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV23-1A0A0A0MS06 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV23-1A0A0A0MS06 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV23-1A0A0A0MS06 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV23-1A0A0A0MS06 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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