Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms