Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 DLC1-212ENST00000515225 582 ntTSL 319.54■□□□□ 0.725e-7■■■■□ 24.1
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PRPF4O43172 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.79e-7■■■■□ 24.1
PRPF4O43172 MZF1-205ENST00000596039 657 ntTSL 216.42■□□□□ 0.229e-7■■■■□ 24.1
PRPF4O43172 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.169e-7■■■■□ 24.1
PRPF4O43172 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-6■■■■□ 24.1
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PRPF4O43172 TRAPPC4-203ENST00000447216 980 ntTSL 217.44■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 24.1
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PRPF4O43172 TRAPPC4-201ENST00000359005 849 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 24.1
PRPF4O43172 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-7■■■■□ 24.1
PRPF4O43172 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 24.1
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PRPF4O43172 PTP4A2-207ENST00000494444 678 ntTSL 54.23□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 24
PRPF4O43172 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 24
PRPF4O43172 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 24
PRPF4O43172 AHCY-202ENST00000468908 675 ntTSL 513.4□□□□□ -0.263e-8■■■■□ 24
PRPF4O43172 MIR3142HG-201ENST00000517927 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-7■■■■□ 24
PRPF4O43172 FBXL19-206ENST00000562798 299 ntTSL 416.78■□□□□ 0.282e-9■■■■□ 24
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PRPF4O43172 RORA-206ENST00000557822 545 ntTSL 414.41□□□□□ -0.11e-7■■■■□ 24
PRPF4O43172 RORA-210ENST00000559343 577 ntTSL 412.61□□□□□ -0.391e-7■■■■□ 24
PRPF4O43172 RORA-207ENST00000558234 3910 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 24
PRPF4O43172 RORA-212ENST00000560004 544 ntTSL 411.08□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 24
PRPF4O43172 RORA-205ENST00000551975 749 ntTSL 39.56□□□□□ -0.881e-7■■■■□ 24
PRPF4O43172 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.061e-7■■■■□ 24
PRPF4O43172 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-7■■■■□ 24
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