Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABEP2Q9H5N1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms