RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412307.3

C10orf55-202, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C10orf55, Length 2,360 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-202ENST00000412307 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.58■■■■■ 5.05
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C10orf55-202ENST00000412307 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.97■■■■□ 3.83
C10orf55-202ENST00000412307 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.75■■■■□ 3.79
C10orf55-202ENST00000412307 ABCC9O60706 1549 aa38.3■■■■□ 3.72
C10orf55-202ENST00000412307 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.24■■■■□ 3.71
C10orf55-202ENST00000412307 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.61■■■■□ 3.61
C10orf55-202ENST00000412307 NACADO15069 1562 aa37.47■■■■□ 3.59
C10orf55-202ENST00000412307 SCRIBQ14160 1630 aa37.43■■■■□ 3.58
C10orf55-202ENST00000412307 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
C10orf55-202ENST00000412307 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.13■■■■□ 3.53
C10orf55-202ENST00000412307 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.52■■■■□ 3.44
C10orf55-202ENST00000412307 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.42■■■■□ 3.42
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C10orf55-202ENST00000412307 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
C10orf55-202ENST00000412307 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.15■■■■□ 3.38
C10orf55-202ENST00000412307 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.15■■■■□ 3.38
C10orf55-202ENST00000412307 WIZO95785 1651 aa35.88■■■■□ 3.33
C10orf55-202ENST00000412307 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
C10orf55-202ENST00000412307 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.79■■■■□ 3.32
C10orf55-202ENST00000412307 SMARCA4P51532 1647 aa35.72■■■■□ 3.31
C10orf55-202ENST00000412307 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.14■■■■□ 3.22
C10orf55-202ENST00000412307 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.14■■■■□ 3.22
C10orf55-202ENST00000412307 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.11■■■■□ 3.21
C10orf55-202ENST00000412307 SMARCA2P51531 1590 aa35.07■■■■□ 3.2
C10orf55-202ENST00000412307 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
C10orf55-202ENST00000412307 TRIM41Q8WV44 630 aa34.98■■■■□ 3.19
C10orf55-202ENST00000412307 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
C10orf55-202ENST00000412307 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.7■■■■□ 3.14
C10orf55-202ENST00000412307 NCAPD3P42695 1498 aa34.69■■■■□ 3.14
C10orf55-202ENST00000412307 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
C10orf55-202ENST00000412307 ABCC8Q09428 1581 aa34.61■■■■□ 3.13
C10orf55-202ENST00000412307 HMGXB3Q12766 1538 aa34.55■■■■□ 3.12
C10orf55-202ENST00000412307 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.49■■■■□ 3.11
C10orf55-202ENST00000412307 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.35■■■■□ 3.09
C10orf55-202ENST00000412307 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
C10orf55-202ENST00000412307 SYNJ1O43426 1573 aa34.07■■■■□ 3.04
C10orf55-202ENST00000412307 SOGA1O94964 1423 aa34.06■■■■□ 3.04
C10orf55-202ENST00000412307 CFTRP13569 1480 aa34.04■■■■□ 3.04
C10orf55-202ENST00000412307 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.03■■■■□ 3.04
C10orf55-202ENST00000412307 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.97■■■■□ 3.03
C10orf55-202ENST00000412307 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.93■■■■□ 3.02
C10orf55-202ENST00000412307 TOP2BQ02880 1626 aa33.76■■■■□ 3
C10orf55-202ENST00000412307 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.76■■■□□ 2.99
C10orf55-202ENST00000412307 NESP48681 1621 aa33.74■■■□□ 2.99
C10orf55-202ENST00000412307 CUX1P39880 1505 aa33.73■■■□□ 2.99
C10orf55-202ENST00000412307 PRDM2Q13029 1718 aa33.66■■■□□ 2.98
C10orf55-202ENST00000412307 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.66■■■□□ 2.98
C10orf55-202ENST00000412307 EEA1Q15075 1411 aa33.62■■■□□ 2.97
C10orf55-202ENST00000412307 HRCP23327 699 aa33.59■■■□□ 2.97
C10orf55-202ENST00000412307 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.57■■■□□ 2.97
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C10orf55-202ENST00000412307 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.38■■■□□ 2.93
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C10orf55-202ENST00000412307 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.32■■■□□ 2.93
C10orf55-202ENST00000412307 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.32■■■□□ 2.92
C10orf55-202ENST00000412307 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.29■■■□□ 2.92
C10orf55-202ENST00000412307 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.27■■■□□ 2.92
C10orf55-202ENST00000412307 CEP162Q5TB80 1403 aa33.26■■■□□ 2.92
C10orf55-202ENST00000412307 KIF27Q86VH2 1401 aa33.25■■■□□ 2.91
C10orf55-202ENST00000412307 KIF21BO75037 1637 aa33.23■■■□□ 2.91
C10orf55-202ENST00000412307 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.22■■■□□ 2.91
C10orf55-202ENST00000412307 TOPBP1Q92547 1522 aa33.22■■■□□ 2.91
C10orf55-202ENST00000412307 CUX2O14529 1486 aa33.21■■■□□ 2.91
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C10orf55-202ENST00000412307 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.17■■■□□ 2.9
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C10orf55-202ENST00000412307 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.14■■■□□ 2.9
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C10orf55-202ENST00000412307 IGF1RP08069 1367 aa33.05■■■□□ 2.88
C10orf55-202ENST00000412307 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
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C10orf55-202ENST00000412307 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.93■■■□□ 2.86
C10orf55-202ENST00000412307 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.91■■■□□ 2.86
C10orf55-202ENST00000412307 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
C10orf55-202ENST00000412307 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.87■■■□□ 2.85
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C10orf55-202ENST00000412307 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
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C10orf55-202ENST00000412307 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.59■■■□□ 2.81
C10orf55-202ENST00000412307 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.57■■■□□ 2.8
C10orf55-202ENST00000412307 ARAP1Q96P48 1450 aa32.55■■■□□ 2.8
C10orf55-202ENST00000412307 WDR62O43379 1518 aa32.54■■■□□ 2.8
C10orf55-202ENST00000412307 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.5■■■□□ 2.79
C10orf55-202ENST00000412307 CUL7Q14999 1698 aa32.48■■■□□ 2.79
C10orf55-202ENST00000412307 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
C10orf55-202ENST00000412307 P3H3Q8IVL6 736 aa32.45■■■□□ 2.79
C10orf55-202ENST00000412307 APLP2Q06481 763 aa32.42■■■□□ 2.78
C10orf55-202ENST00000412307 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
C10orf55-202ENST00000412307 IFT140Q96RY7 1462 aa32.39■■■□□ 2.78
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