Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NGDN-211ENST00000556699 725 ntTSL 27.65□□□□□ -1.189e-9■■■■■ 31
PABPC4Q13310 NGDN-210ENST00000556580 629 ntTSL 27.56□□□□□ -1.29e-9■■■■■ 31
PABPC4Q13310 NGDN-204ENST00000553439 2763 ntTSL 26.85□□□□□ -1.319e-9■■■■■ 31
PABPC4Q13310 MRPL28-204ENST00000441883 800 ntTSL 532.81■■■□□ 2.843e-8■■■■■ 31
PABPC4Q13310 APRT-210ENST00000568575 490 ntTSL 215.54■□□□□ 0.087e-21■■■■■ 31
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-215ENST00000636646 2151 ntTSL 525.35■■□□□ 1.651e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-212ENST00000636089 2230 ntTSL 524.93■■□□□ 1.581e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-201ENST00000463721 1836 ntTSL 224.31■■□□□ 1.481e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-226ENST00000637696 2373 ntTSL 523.04■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-208ENST00000635951 2168 ntTSL 522.19■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-217ENST00000636718 2499 ntTSL 521.72■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-207ENST00000635946 2459 ntTSL 520.99■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-220ENST00000637025 2926 ntTSL 519.07■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-218ENST00000636826 2940 ntTSL 519.01■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-221ENST00000637130 3158 ntTSL 517.75■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-214ENST00000636490 3067 ntTSL 515.66■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 30.9
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PABPC4Q13310 EEF1B2-208ENST00000455150 670 ntTSL 57.69□□□□□ -1.182e-49■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 30.9
PABPC4Q13310 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.941e-16■■■■■ 30.8
PABPC4Q13310 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.341e-16■■■■■ 30.8
PABPC4Q13310 ISG20L2-205ENST00000472824 3178 ntTSL 513.96□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 30.8
PABPC4Q13310 ISG20L2-201ENST00000313146 3303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.211e-9■■■■■ 30.8
PABPC4Q13310 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-39■■■■■ 30.7
PABPC4Q13310 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-39■■■■■ 30.7
PABPC4Q13310 CD3D-201ENST00000300692 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-9■■■■■ 30.7
PABPC4Q13310 CD3D-204ENST00000529594 422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-9■■■■■ 30.7
PABPC4Q13310 CD3D-205ENST00000534687 483 ntTSL 25.35□□□□□ -1.551e-9■■■■■ 30.7
PABPC4Q13310 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.681e-9■■■■■ 30.7
PABPC4Q13310 CD3D-203ENST00000526561 257 ntTSL 24.48□□□□□ -1.691e-9■■■■■ 30.7
PABPC4Q13310 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.021e-6■■■■■ 30.7
PABPC4Q13310 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.24□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 CNIH1-207ENST00000557690 838 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.255e-60■■■■■ 30.6
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PABPC4Q13310 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.812e-17■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.762e-17■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-17■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.332e-17■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 PLD3-212ENST00000486134 327 ntTSL 216.32■□□□□ 0.22e-17■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 RPS15A-204ENST00000563579 284 ntTSL 33.98□□□□□ -1.771e-18■■■■■ 30.6
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PABPC4Q13310 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.871e-13■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.961e-13■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.961e-13■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.011e-13■■■■■ 30.6
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PABPC4Q13310 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.471e-13■■■■■ 30.6
PABPC4Q13310 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.228e-8■■■■■ 30.5
PABPC4Q13310 TMEM120A-204ENST00000440632 1352 ntTSL 521.91■■□□□ 1.18e-8■■■■■ 30.5
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PABPC4Q13310 TMEM120A-213ENST00000490656 660 ntTSL 319.22■□□□□ 0.678e-8■■■■■ 30.5
PABPC4Q13310 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.678e-8■■■■■ 30.5
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PABPC4Q13310 TMEM120A-205ENST00000460127 408 ntTSL 315.94■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 30.5
PABPC4Q13310 NAA10-207ENST00000460996 908 ntTSL 221.57■■□□□ 1.041e-8■■■■■ 30.5
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PABPC4Q13310 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.021e-10■■■■■ 30.5
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PABPC4Q13310 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 211.53□□□□□ -0.561e-10■■■■■ 30.5
PABPC4Q13310 RBM22-204ENST00000520132 2067 ntTSL 211□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 RBM22-201ENST00000199814 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.733e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.723e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.123e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.743e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.73e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MPST-207ENST00000485587 5872 ntTSL 218.1■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MRPL55-228ENST00000476267 169 ntTSL 316.07■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MRPL55-227ENST00000475832 858 ntTSL 513.92□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 LRRFIP2-212ENST00000460646 2857 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.864e-11■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.285e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.21■■■□□ 2.275e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-213ENST00000568062 580 ntTSL 328.8■■■□□ 2.25e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SH2B1-209ENST00000563674 719 ntTSL 327.84■■■□□ 2.055e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.025e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.85e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.595e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.485e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.375e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SH2B1-215ENST00000569651 821 ntTSL 523.27■■□□□ 1.325e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-208ENST00000563530 382 ntTSL 423.11■■□□□ 1.295e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 GTF3C1-207ENST00000567806 584 ntTSL 423.07■■□□□ 1.285e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.285e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-210ENST00000566407 922 ntTSL 322.92■■□□□ 1.265e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.035e-7■■■■■ 30.4
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 429.2 ms