RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568062.5

ZFYVE19-213, Transcript of zinc finger FYVE-type containing 19, humanhuman

TSL 3

Gene ZFYVE19, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE19-213ENST00000568062 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.73■■■■■ 6.99
ZFYVE19-213ENST00000568062 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.51■■■■■ 6
ZFYVE19-213ENST00000568062 ABCC9O60706 1549 aa52.05■■■■■ 5.92
ZFYVE19-213ENST00000568062 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.81■■■■■ 5.56
ZFYVE19-213ENST00000568062 NACADO15069 1562 aa49.6■■■■■ 5.53
ZFYVE19-213ENST00000568062 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.33■■■■■ 5.49
ZFYVE19-213ENST00000568062 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.13■■■■■ 5.45
ZFYVE19-213ENST00000568062 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
ZFYVE19-213ENST00000568062 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.63■■■■■ 5.37
ZFYVE19-213ENST00000568062 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.53■■■■■ 5.36
ZFYVE19-213ENST00000568062 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.49■■■■■ 5.35
ZFYVE19-213ENST00000568062 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.43■■■■■ 5.34
ZFYVE19-213ENST00000568062 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.27■■■■■ 5.32
ZFYVE19-213ENST00000568062 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.85■■■■■ 5.25
ZFYVE19-213ENST00000568062 SCRIBQ14160 1630 aa47.79■■■■■ 5.24
ZFYVE19-213ENST00000568062 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
ZFYVE19-213ENST00000568062 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.05■■■■■ 5.12
ZFYVE19-213ENST00000568062 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.9■■■■■ 5.1
ZFYVE19-213ENST00000568062 NCAPD3P42695 1498 aa45.8■■■■■ 4.92
ZFYVE19-213ENST00000568062 SMARCA4P51532 1647 aa45.69■■■■■ 4.9
ZFYVE19-213ENST00000568062 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.68■■■■■ 4.9
ZFYVE19-213ENST00000568062 SMARCA2P51531 1590 aa45.59■■■■■ 4.89
ZFYVE19-213ENST00000568062 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
ZFYVE19-213ENST00000568062 HMGXB3Q12766 1538 aa45.47■■■■■ 4.87
ZFYVE19-213ENST00000568062 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.32■■■■■ 4.85
ZFYVE19-213ENST00000568062 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
ZFYVE19-213ENST00000568062 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.21■■■■■ 4.83
ZFYVE19-213ENST00000568062 ERCC6Q03468 1493 aa44.97■■■■■ 4.79
ZFYVE19-213ENST00000568062 NESP48681 1621 aa44.81■■■■■ 4.76
ZFYVE19-213ENST00000568062 CUX2O14529 1486 aa44.8■■■■■ 4.76
ZFYVE19-213ENST00000568062 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.67■■■■■ 4.74
ZFYVE19-213ENST00000568062 WIZO95785 1651 aa44.64■■■■■ 4.74
ZFYVE19-213ENST00000568062 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
ZFYVE19-213ENST00000568062 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.44■■■■■ 4.7
ZFYVE19-213ENST00000568062 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.42■■■■■ 4.7
ZFYVE19-213ENST00000568062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
ZFYVE19-213ENST00000568062 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.26■■■■■ 4.68
ZFYVE19-213ENST00000568062 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
ZFYVE19-213ENST00000568062 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.2■■■■■ 4.67
ZFYVE19-213ENST00000568062 CFTRP13569 1480 aa44■■■■■ 4.63
ZFYVE19-213ENST00000568062 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.98■■■■■ 4.63
ZFYVE19-213ENST00000568062 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.89■■■■■ 4.62
ZFYVE19-213ENST00000568062 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.87■■■■■ 4.61
ZFYVE19-213ENST00000568062 WDR62O43379 1518 aa43.85■■■■■ 4.61
ZFYVE19-213ENST00000568062 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.68■■■■■ 4.58
ZFYVE19-213ENST00000568062 PRDM2Q13029 1718 aa43.45■■■■■ 4.55
ZFYVE19-213ENST00000568062 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
ZFYVE19-213ENST00000568062 ABCC8Q09428 1581 aa43.12■■■■■ 4.49
ZFYVE19-213ENST00000568062 TOPBP1Q92547 1522 aa43.07■■■■■ 4.49
ZFYVE19-213ENST00000568062 IFT140Q96RY7 1462 aa43.03■■■■■ 4.48
ZFYVE19-213ENST00000568062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.96■■■■■ 4.47
ZFYVE19-213ENST00000568062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
ZFYVE19-213ENST00000568062 OSCARQ8IYS5 282 aa42.82■■■■■ 4.45
ZFYVE19-213ENST00000568062 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
ZFYVE19-213ENST00000568062 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
ZFYVE19-213ENST00000568062 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
ZFYVE19-213ENST00000568062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
ZFYVE19-213ENST00000568062 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.4
ZFYVE19-213ENST00000568062 SOGA1O94964 1423 aa42.5■■■■■ 4.39
ZFYVE19-213ENST00000568062 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.46■■■■■ 4.39
ZFYVE19-213ENST00000568062 CUX1P39880 1505 aa42.46■■■■■ 4.39
ZFYVE19-213ENST00000568062 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.44■■■■■ 4.38
ZFYVE19-213ENST00000568062 TRIM41Q8WV44 630 aa42.41■■■■■ 4.38
ZFYVE19-213ENST00000568062 WDR97A6NE52 1622 aa42.35■■■■■ 4.37
ZFYVE19-213ENST00000568062 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
ZFYVE19-213ENST00000568062 FBLN2P98095 1184 aa42.15■■■■■ 4.34
ZFYVE19-213ENST00000568062 CHD1O14646 1710 aa42.14■■■■■ 4.34
ZFYVE19-213ENST00000568062 GRIN2BQ13224 1484 aa42.11■■■■■ 4.33
ZFYVE19-213ENST00000568062 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.1■■■■■ 4.33
ZFYVE19-213ENST00000568062 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.1■■■■■ 4.33
ZFYVE19-213ENST00000568062 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.1■■■■■ 4.33
ZFYVE19-213ENST00000568062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.1■■■■■ 4.33
ZFYVE19-213ENST00000568062 ARHGEF11O15085 1522 aa42.07■■■■■ 4.33
ZFYVE19-213ENST00000568062 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
ZFYVE19-213ENST00000568062 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.04■■■■■ 4.32
ZFYVE19-213ENST00000568062 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.99■■■■■ 4.31
ZFYVE19-213ENST00000568062 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.31
ZFYVE19-213ENST00000568062 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
ZFYVE19-213ENST00000568062 TOP2BQ02880 1626 aa41.92■■■■■ 4.3
ZFYVE19-213ENST00000568062 SYNJ2O15056 1496 aa41.92■■■■■ 4.3
ZFYVE19-213ENST00000568062 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.9■■■■■ 4.3
ZFYVE19-213ENST00000568062 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.88■■■■■ 4.3
ZFYVE19-213ENST00000568062 PBRM1Q86U86 1689 aa41.84■■■■■ 4.29
ZFYVE19-213ENST00000568062 SYNJ1O43426 1573 aa41.83■■■■■ 4.29
ZFYVE19-213ENST00000568062 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.78■■■■■ 4.28
ZFYVE19-213ENST00000568062 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.73■■■■■ 4.27
ZFYVE19-213ENST00000568062 ARAP1Q96P48 1450 aa41.66■■■■■ 4.26
ZFYVE19-213ENST00000568062 GRIN2AQ12879 1464 aa41.54■■■■■ 4.24
ZFYVE19-213ENST00000568062 ADAMTS12P58397 1594 aa41.54■■■■■ 4.24
ZFYVE19-213ENST00000568062 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.53■■■■■ 4.24
ZFYVE19-213ENST00000568062 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.51■■■■■ 4.24
ZFYVE19-213ENST00000568062 NUP160Q12769 1436 aa41.41■■■■■ 4.22
ZFYVE19-213ENST00000568062 CEP170Q5SW79 1584 aa41.32■■■■■ 4.2
ZFYVE19-213ENST00000568062 KIF27Q86VH2 1401 aa41.18■■■■■ 4.18
ZFYVE19-213ENST00000568062 SHROOM2Q13796 1616 aa41.12■■■■■ 4.17
ZFYVE19-213ENST00000568062 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
ZFYVE19-213ENST00000568062 IGF1RP08069 1367 aa41.09■■■■■ 4.17
ZFYVE19-213ENST00000568062 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.08■■■■■ 4.17
ZFYVE19-213ENST00000568062 JPH4Q96JJ6 628 aa40.98■■■■■ 4.15
ZFYVE19-213ENST00000568062 CUL7Q14999 1698 aa40.97■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms