Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms