Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA4Q9GZZ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GFRA4Q9GZZ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA4Q9GZZ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFRA4Q9GZZ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA4Q9GZZ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA4Q9GZZ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA4Q9GZZ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA4Q9GZZ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFRA4Q9GZZ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFRA4Q9GZZ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFRA4Q9GZZ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GFRA4Q9GZZ7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFRA4Q9GZZ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GFRA4Q9GZZ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFRA4Q9GZZ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFRA4Q9GZZ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFRA4Q9GZZ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFRA4Q9GZZ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA4Q9GZZ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA4Q9GZZ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA4Q9GZZ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA4Q9GZZ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA4Q9GZZ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA4Q9GZZ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA4Q9GZZ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA4Q9GZZ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA4Q9GZZ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA4Q9GZZ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA4Q9GZZ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA4Q9GZZ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA4Q9GZZ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA4Q9GZZ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA4Q9GZZ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA4Q9GZZ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA4Q9GZZ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA4Q9GZZ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GFRA4Q9GZZ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GFRA4Q9GZZ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GFRA4Q9GZZ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GFRA4Q9GZZ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA4Q9GZZ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA4Q9GZZ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA4Q9GZZ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA4Q9GZZ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA4Q9GZZ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA4Q9GZZ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA4Q9GZZ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA4Q9GZZ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA4Q9GZZ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA4Q9GZZ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA4Q9GZZ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA4Q9GZZ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA4Q9GZZ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA4Q9GZZ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA4Q9GZZ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA4Q9GZZ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA4Q9GZZ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA4Q9GZZ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA4Q9GZZ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA4Q9GZZ7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA4Q9GZZ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA4Q9GZZ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRA4Q9GZZ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA4Q9GZZ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA4Q9GZZ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA4Q9GZZ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA4Q9GZZ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA4Q9GZZ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA4Q9GZZ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA4Q9GZZ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA4Q9GZZ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA4Q9GZZ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA4Q9GZZ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA4Q9GZZ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GFRA4Q9GZZ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GFRA4Q9GZZ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GFRA4Q9GZZ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GFRA4Q9GZZ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GFRA4Q9GZZ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA4Q9GZZ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA4Q9GZZ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA4Q9GZZ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA4Q9GZZ7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA4Q9GZZ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GFRA4Q9GZZ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA4Q9GZZ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA4Q9GZZ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFRA4Q9GZZ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFRA4Q9GZZ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFRA4Q9GZZ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFRA4Q9GZZ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFRA4Q9GZZ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA4Q9GZZ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA4Q9GZZ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA4Q9GZZ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA4Q9GZZ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA4Q9GZZ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms