Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMSP20962 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTMSP20962 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTMSP20962 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTMSP20962 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTMSP20962 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTMSP20962 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMSP20962 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMSP20962 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMSP20962 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMSP20962 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMSP20962 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMSP20962 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMSP20962 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTMSP20962 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMSP20962 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMSP20962 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMSP20962 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMSP20962 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTMSP20962 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMSP20962 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMSP20962 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMSP20962 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMSP20962 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMSP20962 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMSP20962 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMSP20962 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTMSP20962 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMSP20962 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMSP20962 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMSP20962 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMSP20962 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMSP20962 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMSP20962 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMSP20962 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMSP20962 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTMSP20962 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTMSP20962 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms