Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKMT2P17540 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CKMT2P17540 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKMT2P17540 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms