Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.122e-6■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.52e-7■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.896e-13■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 TSG101-203ENST00000535077 685 ntTSL 319.98■□□□□ 0.796e-13■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 TSG101-210ENST00000545247 783 ntTSL 319.13■□□□□ 0.656e-13■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 TSG101-202ENST00000438874 581 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.616e-13■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-8■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.296e-13■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 C9orf78-206ENST00000492991 478 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 TSG101-209ENST00000544804 391 ntTSL 315.28■□□□□ 0.046e-13■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 C9orf78-202ENST00000461349 783 ntTSL 312.17□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 C9orf78-203ENST00000461539 637 ntTSL 510.35□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 42.3
DDX3XO00571 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.461e-15■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.421e-15■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 AP000311.1-201ENST00000429238 1078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.975e-13■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.672e-29■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.662e-29■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 PREB-203ENST00000416802 564 ntTSL 425.05■■□□□ 1.62e-29■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 PREB-206ENST00000444452 2030 ntTSL 1 (best)24.33■■□□□ 1.492e-29■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 PREB-209ENST00000474802 1283 ntTSL 520.16■□□□□ 0.822e-29■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 PREB-208ENST00000468045 3057 ntTSL 219.37■□□□□ 0.692e-29■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 NAPG-203ENST00000580483 1516 ntTSL 312.29□□□□□ -0.448e-10■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 NAPG-204ENST00000580746 743 ntTSL 28.46□□□□□ -1.068e-10■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 NAPG-202ENST00000580224 1245 ntTSL 27.48□□□□□ -1.218e-10■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.268e-10■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 NAPG-206ENST00000582978 887 ntTSL 24.74□□□□□ -1.658e-10■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 M6PR-205ENST00000540837 648 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 MS4A3-204ENST00000525686 746 ntTSL 311.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 MS4A3-202ENST00000358152 1516 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 42.2
DDX3XO00571 UGGT1-204ENST00000430075 586 ntTSL 415.99■□□□□ 0.152e-13■■■■■ 42.1
DDX3XO00571 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.092e-13■■■■■ 42.1
DDX3XO00571 UGGT1-205ENST00000438277 3113 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.172e-13■■■■■ 42.1
DDX3XO00571 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.433e-13■■■■■ 42.1
DDX3XO00571 PAQR3-207ENST00000511594 2288 ntTSL 512.09□□□□□ -0.479e-17■■■■■ 42.1
DDX3XO00571 PAQR3-206ENST00000508599 549 ntTSL 411.23□□□□□ -0.619e-17■■■■■ 42.1
DDX3XO00571 PAQR3-212ENST00000515853 3370 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.39e-17■■■■■ 42.1
DDX3XO00571 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.271e-25■■■■■ 42.1
DDX3XO00571 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 219.18■□□□□ 0.662e-51■■■■■ 42
DDX3XO00571 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 515.55■□□□□ 0.082e-51■■■■■ 42
DDX3XO00571 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.321e-10■■■■■ 42
DDX3XO00571 KDSR-210ENST00000590056 462 ntTSL 326.41■■□□□ 1.821e-10■■■■■ 42
DDX3XO00571 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.712e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.632e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.612e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 CDAN1-203ENST00000563260 285 ntTSL 324.93■■□□□ 1.582e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.489e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 RANGRF-204ENST00000578849 607 ntTSL 223.88■■□□□ 1.412e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.382e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 CRAT-204ENST00000441796 831 ntTSL 523.56■■□□□ 1.362e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 223.55■■□□□ 1.369e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 MAPT-AS1-202ENST00000579599 1190 ntTSL 1 (best)23.38■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 CRAT-207ENST00000458362 2253 ntTSL 1 (best)22.57■■□□□ 1.22e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.192e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.049e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 ETHE1-204ENST00000598330 915 ntTSL 221.47■■□□□ 1.039e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 ETHE1-206ENST00000602138 648 ntTSL 321.36■■□□□ 1.019e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 ETHE1-203ENST00000595115 593 ntTSL 221.32■■□□□ 19e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 19e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 RSAD1-208ENST00000515221 1029 ntTSL 221.27■■□□□ 11e-13■■■■■ 42
DDX3XO00571 CRAT-206ENST00000455830 595 ntTSL 521.22■□□□□ 0.992e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.941e-13■■■■■ 42
DDX3XO00571 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 KDSR-208ENST00000589530 588 ntTSL 220.27■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 42
DDX3XO00571 KDSR-212ENST00000592327 553 ntTSL 420.14■□□□□ 0.811e-10■■■■■ 42
DDX3XO00571 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.692e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 MAPT-AS1-201ENST00000579244 632 ntTSL 218.56■□□□□ 0.562e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 RSAD1-202ENST00000443328 1044 ntTSL 218.45■□□□□ 0.541e-13■■■■■ 42
DDX3XO00571 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.529e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.59e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 RSAD1-203ENST00000504284 1064 ntTSL 518.18■□□□□ 0.51e-13■■■■■ 42
DDX3XO00571 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.441e-10■■■■■ 42
DDX3XO00571 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 TMEM107-202ENST00000417073 480 ntTSL 317.17■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 YIPF1-205ENST00000469457 1009 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 YIPF1-204ENST00000465897 808 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 KDSR-206ENST00000587292 569 ntTSL 516.48■□□□□ 0.231e-10■■■■■ 42
DDX3XO00571 ARHGAP17-207ENST00000571480 645 ntTSL 416.46■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 CRAT-208ENST00000464290 867 ntTSL 316.23■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-12■■■■■ 42
DDX3XO00571 ARHGAP17-211ENST00000573449 574 ntTSL 315.65■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 TMEM107-207ENST00000529756 830 ntTSL 215.59■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 514.93□□□□□ -0.029e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 YIPF1-206ENST00000472983 792 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 42
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 1931.7 ms